Mulți compuși sunt purificați prin cristalizare dintr-o soluție apoasă. Cristalul exclude mulți contaminanți, cu toate acestea, apa se poate încadra în rețeaua cristalină fără a fi legată chimic de cationul compusului. Aplicarea căldurii poate alunga această apă, dar procesul de obicei dăunează structurii cristaline. Acest lucru este bine, dacă scopul este de a obține un compus pur. Poate fi nedorit atunci când se cultivă cristale pentru cristalografie sau alte scopuri.
Uneori, cele două forme sunt combinate. De exemplu, [Cu (H2O)4]ASA DE4· H2O poate fi utilizat pentru a descrie apa de cristalizare a sulfatului de cupru (II).
Apa este o moleculă mică, polară, care este încorporată cu ușurință în rețelele de cristal, dar nu este singurul solvent găsit în cristale. De fapt, majoritatea solvenților rămân, într-o măsură mai mare sau mai mică, în cristal. Un exemplu obișnuit este benzenul. Pentru a reduce la minimum efectul unui solvent, chimiștii încearcă de obicei să îndepărteze cât mai mult folosind extracția în vid și pot încălzi o probă pentru a alunga solventul rezidual. Cristalografia cu raze X poate detecta adesea solventul într-un cristal.