Compușii moleculari conțin două sau mai multe nemetale (nu ionul de amoniu). De obicei, puteți recunoaște un compus molecular deoarece primul element din numele compusului este un nemetal. Unii compuși moleculari conțin hidrogen, însă, dacă vedeți un compus care începe cu "H", puteți presupune că este un acid și nu un compus molecular. Compușii care constau numai din carbon cu hidrogen sunt numiți hidrocarburi. Hidrocarburile au propria lor nomenclatură specială, deci sunt tratate diferit față de alți compuși moleculari.
Nemetalele se pot combina într-o varietate de raporturi, de aceea este important ca numele unui compus molecular să indice câți atomi din fiecare tip de element sunt prezenți în compus. Acest lucru se realizează cu ajutorul prefixelor. Dacă există un singur atom al primului element, nu se utilizează niciun prefix. Este obișnuit să prefixăm numele unui atom al celui de-al doilea element cu mono-. De exemplu, CO este denumit monoxid de carbon și nu oxid de carbon.
Puteți scrie formula pentru un compus covalent de la numele său, scriind simbolurile pentru primul și al doilea element și transpunând prefixele în abonamente. De exemplu, hexafluorura de xenon ar fi scrisă XF
6. Este frecvent ca elevii să aibă probleme de scriere a formulelor din numele compușilor, deoarece compușii ionici și compușii covalenți sunt adesea confuzați. Nu echilibrezi sarcinile compușilor covalenți; dacă compusul nu conține un metal, nu încercați să echilibrați acest lucru!