Izomerii sunt molecule care au aceleași formula chimica dar atomii individuali sunt aranjați diferit în spațiu. Izomerismul geometric se referă la tipul de izomer în care atomii individuali sunt în aceeași ordine, dar reușesc să se aranjeze diferit spațial. Prefixele cis și trans- sunt utilizate în chimie pentru a descrie izomerismul geometric.
Această moleculă este 1,2-dicloretan (C2H4CI2). Bilele verzi reprezintă atomii de clor din moleculă. Al doilea model poate fi format prin răsucirea moleculă în jurul legăturii unice central-carbon. Ambele modele reprezintă aceeași moleculă și sunt nu izomeri.
Aceste molecule sunt 1,2-dicloretan (C2H2CI2). Diferența dintre acestea și 1,2-dicloretanul este că cei doi atomi de hidrogen sunt înlocuiți de o legătură suplimentară între cei doi atomi de carbon. Legături duble se formează atunci când p orbitalii între doi atomi se suprapun. Dacă atomul s-ar răsuci, aceste orbitale nu s-ar mai suprapune și legătura s-ar rupe. Legătura dublă carbon-carbon previne rotirea liberă a atomilor în molecule. Aceste două molecule au aceiași atomi, dar sunt molecule diferite. Sunt
izomeri geometrici unul de altul.În nomenclatura de izomeri geometrici, prefixul cis- și trans- sunt folosiți pentru a identifica ce parte a dublei legături se găsesc atomii similari. Prefixul cis- provine din latinescul care înseamnă „din această parte”. În acest caz, atomii de clor sunt de aceeași parte a legăturii duble carbon-carbon. Acest izomer se numește cis-1,2-dicloretan.
Prefixul trans este de la latină care înseamnă „peste”. În acest caz, atomii de clor sunt dublă legătură între ei. Acest izomer se numește trans-1,2-dicloretan.
Compușii aliciclici sunt molecule de inel nearomatic. Când doi atomi sau grupuri substituente se îndoaie în aceeași direcție, molecula este prefixată de cis-. Această moleculă este cis-1,2-diclorociclohexan.
Există multe diferențe în ceea ce privește proprietățile fizice ale izomerilor cis și trans. Cisomizerii tind să aibă puncte de fierbere mai mari decât contrapartidele lor. Transisomerii au, în general, mai mici puncte de topire și au densități mai mici decât omologii lor cis. Cizomizorii colectează sarcina pe o parte a moleculei, oferind moleculei un efect polar total. Transizomerii echilibrează dipolii individuali și au o tendință nepolară.
Stereoizomerii pot fi descriși folosind o altă notare în afară de cis- și trans-. De exemplu, izomerii E / Z sunt izomeri de configurație cu orice restricție de rotație. Sistemul E-Z este utilizat în loc de cis-trans pentru compușii care au mai mult de doi substituenți. Când sunt utilizate într-un nume, E și Z sunt scrise cu caractere italice.