La alegerile din 1800 nu au existat candidați la funcția de vicepreședinție „oficiali”. Conform Constituției SUA, alegătorii au făcut două alegeri pentru președinte și cine a primit cele mai multe voturi a devenit președinte. Persoana care a obținut cel de-al doilea vot a devenit vicepreședinte. Acest lucru s-ar schimba odată cu trecerea celui de-al 12-lea amendament.
În ciuda existenței unui candidat oficial la vicepreședinție, Thomas Jefferson a alergat cu Aaron Burr în calitate de coleg de conducere. „Biletul” lor a primit cele mai multe voturi și decizia cine va fi președinte a fost dată alegerilor. John Adams a fost asociat cu Pinckney sau Jay. Cu toate acestea, potrivit Arhivelor Naționale, nu s-a păstrat o evidență oficială a numărului de voturi populare.
A existat o egalitate de vot electoral între Thomas Jefferson și Aaron Burr la 73 de voturi fiecare. Din această cauză, Camera Reprezentanților a ajuns să decidă cine va fi președinte și cine va fi vicepreședinte. Datorită unei campanii intense de
Alexander Hamilton, Thomas Jefferson a fost selectat peste Aaron Burr după 35 de voturi. Acțiunile lui Hamilton ar fi un factor care a dus la moartea sa într-un duel cu Burr în 1804.